制药行业医药废水处理之所以难度很大，原因在于:首先，制药行业产品种类繁多，生产过程种类多而复杂;其次，在制药生产过程中，原材料投入量大，产出比小，其大部分物质最终成为废弃物，因而导致污染问题较突出。尤其是制药生产过程中产生的废水，污染物浓度高、水量大、组分复杂。

　　环境问题一直困扰着制药行业的诸多企业。近年来医药废水处理尤其突出，因为制药企业环保不达标而导致停产，甚而由于企业违规排污致使环境遭受污染的事件屡屡见诸报端。

　　2010年2月，环境保护部首次发布全国污染源普查公报，在工业污染源主要水污染物中，化学需氧量排放量居前的7个行业排放量合计占工业废水厂区排放口化学需氧量排放量的81.1%，医药制造业赫然位列其中。医药废水处理已经迫在眉睫。

　　近年来，国内制药行业为治理医药废水，在探索寻求废水污染治理技术和开展医药废水处理工程升级改造方面投入了大量人力、财力。经过不懈努力，污染减排已取得较大成效，并逐渐形成了一批针对不同类制药废水特点的水污染处理的专有技术和集成工艺。尽管如此，从目前企业污染物排放的现状看，仍仅有少数原料药制药企业和大部分混装制剂类、生物工程类、中药类以及提取类制药企业的废水总排口能直接达到新《标准》排放限值要求。